Международное сотрудничество является неотъемлемой частью деятельности КИСИ при Президенте РК. Соглашения, договора, меморандумы о научном сотрудничестве, заключенные КИСИ с организациями ближнего и дальнего зарубежья создают основу для установления и расширения двустороннего сотрудничества в научно-исследовательской деятельности, содействуют укреплению научного потенциала, обмену опытом, совершенствованию и развитию новых форм взаимодействия посредством реализации совместных аналитических проектов, проведения регулярных экспертных заседании и круглых столов.