Социально-политические процессы в современном Казахстане:

• анализ текущей общественно-политической ситуации в Казахстане;
• комплексное исследование вопросов политической модернизации;
• прогнозирование и моделирование общественно-политических процессов; 
• анализ состояния политических институтов, межэтнических и межконфессиональных отношений, вопросов противодействия религиозному экстремизму и терроризму;
• изучение текущих медийных процессов и информационных трендов.

Стратегические аспекты внешней политики и международных отношений:

• анализ современных международных процессов, геополитических трендов и внешнеполитических стратегий региональных и глобальных игроков;
• мониторинг внутриполитического и социально-экономического развития сопредельных стран;
• изучение вопросов международной и региональной безопасности;
• анализ двусторонних отношений Казахстана с Россией, Китаем, США, Турцией, странами Центральной Азии, Европейского Союза, СНГ и рядом других ведущих азиатских государств;
• исследование интеграционных процессов на региональном и глобальном уровнях.

Социально-экономические процессы в современном Казахстане и мире:

• анализ актуальных проблем развития национальной экономики;
• исследование тенденций и перспектив социального развития Казахстана;
• изучение тенденций развития мировой экономики, интеграционных процессов и их влияния на экономику Казахстана;
• анализ вопросов регионального развития, государственного управления и менеджмента, проблем урбанизации, миграции и демографии;
• исследование вопросов экономической безопасности Казахстана.

Социологические исследования:

• проведение комплексных социологических исследований и мониторингов по актуальным вопросам;
• координация работ по социологическим исследованиям государственных органов и формирование единой базы аналитических данных;
• методологическое сопровождение и методическое обеспечение программ социологических исследований;
• организация экспертных обсуждений результатов опросов  общественного мнения;
• организация и проведение обучающих семинаров  по современным социологическим методам для профильных структур государственных органов.

Информационно-аналитическая и редакционно-издательская деятельность:

• оперативный мониторинг информационного пространства;
• обеспечение связи с общественностью;
• информационное наполнение сайта КИСИ и страниц в социальных сетях (Facebook, Twitter);
• издание научно-аналитических  журналов «Казахстан-Спектр»,  «Коғам және Дәуір», «Central Asia's Affairs»;
• издание книг, монографий, сборников материалов.

Институт проводит фундаментальные и прикладные исследования по стратегическим вопросам внутренней и внешней политики, социально-экономического развития Казахстана, готовит материалы прогнозно-аналитического характера для руководства страны.

По основным направлениям своей деятельности институт регулярно проводит экспертные обсуждения и встречи, конференции, круглые столы и международные форумы.

КИСИ сотрудничает с зарубежными научными и аналитическими структурами, осуществляет международные и региональные исследовательские проекты по актуальным проблемам.